在修缮领域，背水面防水始终是一道棘手的难题。当迎水面因外侧紧邻既有建筑、回填土无法开挖或地下连续墙外部空间丧失而无法施工时，在室内一侧涂刷水泥基渗透结晶防水涂料便成了为数不多的可行选项。然而围绕这种材料在背水面是否真正有效、应该如何施工的疑问，从未在工程师和施工班组之间停歇过。
最常见的质疑是：背水面施工后墙面表面仍然潮湿，这是否代表防水已经完全失效。要理解这个问题，首先需要区分毛细渗透和压力渗流。地下室外墙迎水面一侧的土壤水在静水压力驱动下沿毛细孔和微裂缝向内迁移，如果水压持续且补给稳定，单靠渗透结晶形成的内部填充是不足以抵抗压差的，渗水在表面仍会表现为持续湿渍甚至滴水。但如果水源并非持续有压补给，而是土壤中蓄积的毛细水在蒸发和补给之间维持着动态平衡，渗透结晶处理使混凝土表层数十毫米深度内的毛细孔被结晶填充后，水迁移速率大幅下降，墙面肉眼可见的湿斑便逐渐消失，表面能维持干燥。因此背水面处理后墙面是否干燥，取决于水是否存在持续压力，不能以单次观察断定材料没有起作用。
另一个容易引起误解的问题是，背水面施工前是否必须将基面处理至完全干燥。水泥基渗透结晶涂料本身需要水作为反应载体，活性化学物质在干燥的毛细孔中没有迁移介质，无法完成渗透和结晶。因此施工前不仅不需要把墙弄干，反而要反复洒水充分润湿，使基面达到饱和面干状态——表面不再干白发亮，但也没有明水膜反光。对于正在渗出明水的点状渗漏，必须先用快凝堵漏材料封闭，使水流由流动状态转为面状潮润，再整体涂刷渗透结晶涂料，让活性组分在水为介质的前提下完成渗透结晶。
白色结晶析出物是否需要清除，是使用者和业主经常提出的外观疑虑。涂刷养护完成后常在表面看到一层白色或半透明的粉状或膜状物，这是活性组分与混凝土中钙离子反应生成的副产物，不是霉菌也不是材料变质。它提示渗透结晶反应确实在持续进行，对涂层的防水功能没有削弱作用，一般不建议清除。如果对视觉效果有较高要求，可在养护期结束后用湿布轻轻擦除表面浮白，但禁止使用酸性清洗剂或钢丝刷打磨，这会破坏表层已经建立的致密结晶层。
也有人认为水泥基渗透结晶涂料既然是无机刚性材料，就应该可以替代柔性防水层承担一切变形。事实是它对大于0.3毫米的贯通裂缝和蜂窝孔洞确实无能为力，这些结构缺陷必须在施工前用修补材料进行封闭处理。它适合作为混凝土结构自防水的增强和修补层，与变形缝处的柔性密封材料协同使用，而不是在所有节点都能独当一面。
还有一个容易被误判的点是对背水面使用年限的预期。在持续水压和频繁干湿交替的严酷环境中，活性组分消耗速度加快，渗透深度和结晶密度不可能永久保持。强水压背水面通常五至八年需要补充浸渍处理，维持防护功能，而不是当做一次性投入、终身有效的被动措施。对于已严重碳化丧失碱度的老旧混凝土，活性组分的反应条件已经不具备，必须先喷涂碱活化剂再做渗透结晶，否则渗透深度和结晶质量都会大打折扣。
